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能源作物生产过程中为了达到一定的经济产量而转变土地利用方式并进行集约化生产，农业生产技术也相应影响着土壤、水和农田生物多样性的变化，可能造成诸如水土流失、土壤碳库破坏等所附带的环境成本。我国生物燃料发展较晚，相关研究相对薄弱，加强生物燃料产业发展研究，阐明生物燃料发展对环境的影响，无疑有利于促进我国生物燃料产业的健康发展。
20世纪80年代初，我国开始进行甜高粱能源利用研发。“八五”、“九五”计划期间，甜高粱秸秆制取乙醇被国家科技部列入科技发展规划。发展至今日，我国甜高粱品种、种植以及利用甜高粱茎秆生产乙醇技术已经逐渐成熟。
近些年生物燃料的快速发展加剧了市场对能源作物的需求，大量能源作物单一集约化生产消耗了大量农业用水，占用了大量农业用地，甚至将大量草场、森林快速转化为农田，这些均对水土资源产生了影响。
